Η Εταιρεία Κλινικής Μικροβιολογίας και Εργαστηριακής Διαγνωστικής έχει θεσμοθετήσει:
Βραβείο αξίας χιλίων ευρώ προς τιμήν της Καθηγήτριας της Μικροβιολογίας και Ιδρυτού της Εταιρείας κας Αντιγόνης Αρσένη για πρωτότυπες μελέτες στην Κλινική Μικροβιολογία. Το Βραβείο απονέμεται κάθε δύο χρόνια στο πλαίσιο του Εθνικού Συνεδρίου Κλινικής Μικροβιολογίας που οργανώνει η Ελληνική Μικροβιολογική Εταιρεία.
Βραβεία παρελθόντων ετών
Βραβείο «Α. Αρσένη»
2011
1) Νικόλαος Σιαφάκας, Αχιλλέας Αττιλάκος, Σοφία Βουρλή, Ευστάθιος Στέφος, Ιωσήφ Μελετιάδης, Πολυξένη Νικολαΐδου και Λουκία Ζέρβα
Μοριακή ανίχνευση και επιδημιολογία εντεροϊών σε παιδιατρικούς ασθενείς.
2 ) Μ. Αραμπατζής ,Α. Μηλιώνη, Ε. Ηλία, Α. Βελεγράκη
Αξιολόγηση του υλικού SecSel+ με μεικτές καλλιέργειες για εκλεκτική απομόνωση Scedosporium/Pseudallescheria από ασθενείς με κυστική ίνωση.